植被覆盖度自动计算系统的主要功能包括：

(1)基本功能：包括图像的打开、保存、放大、缩小。

(2)图像预处理：包括图像的旋转、裁剪和几何校正。由于数码相机采用的是中心投影，获取的照片存在几何畸变，因此对图像进行几何校正。

(3)植被覆盖度计算：这部分是系统的核心功能，采用修正的过绿特征模型(Excess Green，ExC)计算玉米、大豆、草地植被覆盖度。

(4)阴影面积比例计算：这部分功能利用阴影指数，通过阀值来提取阴影的面积比例。